Presso il Centro Interdipartimentale di Health Technologies (CHT) dell’Università di Pavia, sono presenti diverse iniziative nel campo dei Big Data per applicazioni in medicina, in clinica e nella ricerca biomedica.
I principali collaboratori delle iniziative nel campo dei Big data per la salute, effettuate in collaborazione fra diversi Dipartimenti, appartengono ai seguenti Laboratori:
Attività: data mining e big data management di dati di ricerca biomedica e di dati clinico/assistenziali.
Laboratorio di Informatica Biomedica “Mario Stefanelli”, Dipartimento di Ingegneria Industriale e dell’Informazione
Spin-Off Universitaria Biomeris
Attività: bioinformatica, analisi e gestione dati NGS.
Laboratorio di Bioinformatica e Biologia Sintetica
Attività: analisi dati di telerilevamento per applicazioni di salute pubblica
Laboratorio di Telecomunicazioni e Remote Sensing, Dipartimento di Ingegneria Industriale e dell’Informazione
Attività: “spatial enablement” nei dati di salute pubblica.
Laboratorio di Geomatica, Dipartimento di Ingegneria Civile e Architettura
Attività: Human Brain project – coordinamento delle attività del nodo di Pavia, analisi dati, simulazione di sistemi fisiologici a larga scala
Il Laboratorio “E. D’angelo” del Dipartimento di Scienze del Sistema Nervoso e del Comportamento dell’Università di Pavia
Brain Connectivity Center, dell’IRCCS Fondazione C. Mondino di Pavia
Attività: Human Brain project – raccolta dei dati clinici che faranno parte della Big Data Platform della sezione di Medicina dello Human Brain Project
Il centro di Neuropsicologia Cognitiva dell’ASST Grande Ospedale Metropolitano Niguarda; convenzionato con il DSSNC
Attività: Human Brain Project: modellazione e simulazione realistica di cellule neuronali
Laboratorio Microcalcolatori e Strumentazione Elettromedicale, Dipartimento di Ingegneria Industriale e dell’Informazione
Attività elaborazione di bio-immagini; machine learning su architetture hardware ad alta prestazione
Laboratorio Microcalcolatori e Strumentazione Elettromedicale, Dipartimento di Ingegneria Industriale e dell’Informazione
Analisi dati a larga scala per applicazioni medico-legali
Laboratorio di Informatica Forense, DIII, Prof. Antonio Barili, Dott. Dario Lanterna
Analisi dei dati SAXS all’ESRF – Progetto: bacterial adhesins and infection
Laboratorio di Nanomedicina per la Rigenerazione tissutale, nanomedicina e controllo delle infezioni, Dipartimento di Medicina Molecolare.
Attività: analisi dei dati di microdifrattometria ottenuti all’ESRF (European Syncrotron Radiation Facility) e analisi dei dati di RnaSeq per il Progetto ASI – NATO (nanoparticles and osteoporosis)
Laboratorio di Nanomedicina per la Rigenerazione tissutale, nanomedicina e controllo delle infezioni, Dipartimento di Medicina Molecolare
I gruppi effettuano inoltre da anni attività di trasferimento tecnologico in ambito di “data mining”,”big data management” e “spatial enablement”, in collaborazione sia con centri di ricerca internazionali di eccellenza e con gli Istituti di Ricovero e Cura di Carattere Scientifico di Pavia.
Si segnalano inoltre:
gli accordi con l’Università di Harvard che comprendono:
- un agreement per lo sviluppo e l’utilizzo del software messo a punto dal Centro di ricerca NIH Informatics for Integrating Biology and the Bedside
- un agreement per lo sviluppo e l’utilizzo del software messo a punto dal Centro di ricerca NIH “Big data to Knowledge” – PIC-SURE
le attività nell’ambito del Working group: “Data Mining and Big Data Analytics” dell’International Medical Informatics Association
le attività nell’ambito del Knowledge discovery in data-bases working group dell’American Medical Informatics Association
le collaborazioni con il Laboratorio di Informatica e Sistemistica per la Ricerca Clinica dell’IRCCS Fondazione S. Maugeri di Pavia
i progetti della Regione Lombardia Onco-i2b2 e i2b2-Hematology
Il progetto Europeo (VII programma quadro) MOSAIC
la nascita delle spin-off accademiche dell’Università di Pavia: Biomeris e Engenome
le collaborazioni con l’Azienda per Tutela della Salute e l’Azienda Socio-Sanitaria Territoriale di Pavia.
I gruppi effettuano inoltre attività di formazione in ambito di big data, principalmente all’interno dei corsi di laurea magistrale in Bioingegneria dove sono previsti insegnamenti di “Data mining e modelli decisionali in Biomedicina”, “Intelligenza Artificiale in Medicina”, nonché del corso di dottorato in “Bioingegneria e Bioinformatica”, che ha organizzato la Summer school internazionale in “Big data for Precision Medicine”