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L'evento "Precision and Translational Medicine on the Cloud" è un Workshop di due giorni organizzato dal Medical College of Wisconsin’s Human and Molecular Genetics Center (Milwaukee, USA).
Il workshop ha come obiettivo quello di diffondere l’uso delle tecnologie cloud per l’analisi dei dati genomici nell’ambito della medicina traslazionale e di precisione mediante le piattaforme cloud dell’FDA Precision Medicine e AmazonAWS.
Il workshop consiste in una serie di seminari dove interverranno professori e ricercatori nell'ambito delle tecnologie informatiche di Precision Medicine provenienti dalle università di Harvard, Stanford, Wisconsin e Pavia. Racconteranno dei propri progetti i ricercatori di istituti quali il Medical College of Wisconsin, il Cincinnati Children’s Hospital e l'Aurora Research Institute. Parleranno delle loro soluzioni ed "use cases" aziende quali Amazon AWS, DNANexus ed Engenome (spinoff dell'Università di Pavia).
Il secondo giorno è previsto un hands-on parallela sia sulla piattaforma cloud della Food and Drug Administration (PrecisionFDA) che sul cloud Amazon AWS per l'analisi dei dati genomici.

Dove:

Il workshop sarà seguito in diretta da Pavia nell'aula seminari al piano D del Dipartimento di Ingegneria Industriale e dell'Informazione.

Quando:

Giovedì 10 e venerdì 11 Novembre 2016, dalle 14.00 alle 18.30. Per motivi di fuso orario, il programma originale dell’evento verrà seguito solo in parte. Di seguito il programma per i due pomeriggi. Per partecipare all’esercitazione del secondo giorno è necessario portare un proprio laptop. 


Coordinatori dell’evento da Pavia:
Susanna Zucca, PhD, Engenome srl
Mattia Chiesa, PhD, Cardiologico Monzino, Milano

 

Agenda

Day 1, Nov 10th

14:30 - Dignitary opening and Introductions

Allen W. Cowley

Professor and Chairman of the Department of Physiology at the Medical College of Wisconsin

Peter J. Tonellato, PhD

Professor of Biostatistics, Zilber School of Public Health, University of Wisconsin

Senior Research Scientist, CBMI, Harvard Medical School

 

15:00 - Precision Medicine, Biomedical Science and Translational Medicine in the era of (clouded) Big Data Science

Dennis Wall, PhD, Stanford Medical School

 

15:30 - Precision medicine applied to the detection and prevention of multidrug-resistant bacterial infections

David Haslam, M.D., Associate Professor of Pediatrics, Director of Antimicrobial Stewardship

Cincinnati Children’s Hospital

Precision Medicine Clouded Initiatives

16:00PrecisionFDA – Driving Precision Medicine on the Cloud

Samir Lababidi, PhD, U.S. Food and Drug Administration

 

16:30Scalable Precision Medicine on Amazon Web Services

Angel Pizarro M.S.E., Technical Business Dev Manager, Scientific Computing, Amazon Web Services

Precision Medicine in Practice

17:00DNA to Diagnosis: Patient First Medical Report

Daniel Helbling, MS, MB(ASCP) CM  Medical College of Wisconsin

 

17:20Challenges of Precision Medicine in the Clinical Molecular Diagnostics Laboratory

Dan Bellissimo, Ph.D. University of Pittsburgh School of Medicine

 

17:40Bioinformatics technologies for translational oncology

Ettore Rizzo, PhD, Faculty, University of Pavia, Founder of Engenome srl 

Ivan Limongelli, PhD, Faculty, University of Pavia, Founder of Engenome srl

 

18:10Big Data Simulation for Precision Clinical Trials

Kourosh Ravvaz, MD, PhD, MPH, Sr. Research Scientist, Aurora Research Institute, Aurora Health

Day 2, Nov 11th 

14:00 Introduction of Translational and Precision Medicine objectives and two-track exercises:

PrecisionFDA App-a-Thon

Precision medicine AWS

Peter J Tonellato

 

14:15precisionFDA platform, team and individual account checks, demonstration

Coordinators: Alan Zhu, DNANexsus

15:00Review of app-a-thon exercises, finalize teams and launch app-a-thon

Coordinators: HMGC Bioinformatics Fellows

15:30Review of AWS Exercises, finalize teams and launch hands-on AWS

Coordinators: Ettore Rizzo, Ivan Limongelli and Yassine Soulimi

Precision Medicine on the Cloud TEAM EXERCISES

16:00 – 18:30Team Exercises